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个人简介教授，博士生导师。1995年本科毕业于南京大学地球科学系，2001年于中科院南京地质古生物研究所获博士学位。2008-2018年任中科院南京地质古生物研究所研究员，2018年11月至今任南京大学地球科学与工程学院二级教授。 长期从事地质大数据及大数据驱动下的深时地球演化研究，近期研究兴趣包括长尺度生物多样性与环境变迁，网络科学与深时生态演化，全球与区域古地理重建，定量地层学与人工智能演化算法、并行计算，地质记录周期性，固体地球科学跨学科数据融合与分析，地学知识图谱与数据挖掘，地学图像识别与虚拟现实等。2019年参与发起国际地科联“深时数字地球”国际大科学计划，致力于固体地球科学领域的全球数据整合、共享与应用，以及深时地球演化研究的范式变革。 发表论著160余篇册，其中SCI、EI收录论文70余篇，论文总引用次数7000次（Google scholar）；专著5部，主编论文集5部。受邀在国际沉积学大会等国际学术会议做特邀报告十余次，先后在加拿大温哥华、奥地利格拉兹、英国肯沃斯、法国巴黎、法国里尔等组织地学大数据短训班或暑期讲座，培养全球地学大数据青年人才。2017年获国家杰出青年基金资助。2018年创建ONEs地学大数据团队。2021年创建中、英、瑞DELTA联盟，聚焦数据驱动下深时生命演化研究。曾先后被著名学术期刊Science和计算机领域旗舰期刊IEEE Spectrum专访。成果被Science、Nature亮点评述，先后入选2020年度中国科学十大进展、两院院士评选中国十大科技进展新闻、中国高校十大科技进展等。曾获江苏省科学技术进步一等奖，中国古生物学会首届青年古生物学奖等。 学术任职： 2022至今：《Geosystems and Geoenvironment》编委 2021至今：《Global and Planetary Change》和《Palaeontologia Electronica》编委 2020至今：《Geoscience Data Journal》副主编 2020至今：国际地层委员会时间标尺校准分会选举委员 2019至今：“深时数字地球”国际大科学计划秘书长，执行委员会委员 2019至今：《地层学杂志》编委 2018至今：中国古生物学会古生态专业委员会理事长 2013至今：全国地层委员会化学地层及定量地层分会副主席 团队与人才： ONEs团队是国际化的地学大数据团队，成员40人，其中教授3人（含全职英籍教授Norman MacLeod），副高3人，包括传统地学和地学大数据专家，以及人工智能、并行计算、数据库等领域专业人才。与英、美、加、中等十余个一流高校和研究机构的地球科学、信息科学的团队有长期稳定合作，包括英国牛津大学、伦敦大学学院、布里斯托大学、英国地调局，瑞士苏黎世大学，法国国家科学中心、里尔大学，美国自然历史博物馆（纽约）、加州大学河滨分校、麻省理工学院、辛辛那提大学、代顿大学，加拿大St. Francis Xavier大学，捷克科学院等。 团队培养的目标是全面发展的“科研精英”，拟招收国内外一流大学地质学、地球化学、古生物学、地理信息系统，以及应用数学、统计学、计算机（软）、人工智能等专业前10%的本硕博和优秀博士后，与团队共发展；硕博只招收应届生，特例仅限各方面杰出、有突出科研产出的往届生；要求勤奋、聪颖、志向明确、雄心勃勃、执行力强；团队提供严格、全面的科研训练以及与国内外一流科学家学习交流的机会；研究方向均为学科交叉、领域前沿、一流科学问题、兴趣驱动；团队每周组织一次科研组会，每四周一次英文组会；每位学生均结合其自身特点定制培养计划；优秀学生必将获得世界著名高校和科研机构长期访学深造的机会；付出=回报。 指导学生： 杨生超，博士后，2020-2023，奥陶-志留纪重大事件的环境背景 徐卉清，博士生，2019-，新生代PETM事件 文蝶，直博生，2020-，深时纬向多样性梯度（伦敦大学学院联合培养博士生，留学一年半） 鲁铮博，硕转博，2020-，新生代E-O事件（伦敦大学学院联合培养博士生，留学两年） 徐琪，硕士生，2020-，古生态与食物网 赖牧晨，硕士生，2021-，古生代植物多样性，史宇坤教授主指导 宋思存，博士生，2022-，深时生命形态演化，Norman MacLeod教授主指导 马晓理，博士生，2022-，深时环境变迁 沙荣花，直博生，2022-，地质记录周期性 沈含笑，硕士生，2022-，地学虚拟现实 黄汉晖，本科生（直博），AI与化石图像识别；博士，深时生物地理（牛津大学） 施玉洁，本科生（保研），晚泥盆纪FF大灭绝事件 储添翼，本科生（保研），Modelling 朱米西，国科大博士生，2022-，深时地球演化 赵石珂，国科大硕士生，2022-，地外行星演化 已毕业学生：所有毕业博士生均在中国科学院或高校任职 陈清，2013年博士毕业，中科院南京地质古生物研究所，副研究员；美国Dayton大学博士后 张琳娜，2016年博士毕业，中科院南京地质古生物研究所，助研 陈中阳，2017年博士毕业，中科院南京地质古生物研究所，副研究员 孙宗元，2018年博士毕业，成都理工大学，讲师；加拿大St. Francis Xavier大学博士后；捷克科学院访问学者 邓怡颖，2022年博士毕业，合肥工业大学，讲师 近期招收博士后计划：（2023年11月或2024年5月） 1. 古植物、古脊椎动物或中、新生代地层古生物背景，有兴趣未来从事古生物大数据研究 2. 沉积地化背景，有兴趣未来从事重大生物事件背后的环境机制研究或地化大数据研究 3. 有孔虫方向，Norman MacLeod教授指导，他是世界三大古生物研究中心之一——英国自然历史博物馆古生物部前主任 要求： 1. 多篇高质量一作成果 2. 一流大学或中科院毕业，经历过严格的科研训练，基本功扎实 3. 聪颖，学习能力强，有良好的团队合作能力 4. 具备较好的英文交流能力 提供资源： 1. 研究必须的一切资源、经费，以及广泛的国内外合作 2. 以团队为支撑，申请国家博新计划、基金委青年基金、优青等人才项目 3. 世界一流的学术视野的指导，与大数据交叉的前沿方向 4. 纯正英文的写作指导，等等 教育经历工作经历学术兼职研究方向主要开展地质大数据及大数据驱动下的深时地球演化研究。 近期研究方向包括： 1. 基于地质大数据和高性能计算的高分辨率地质时间轴的建立； 2. 地质历史长尺度生物多样性； 3. 重大生物事件如大灭绝、大辐射的过程与影响机制； 4. C、O、S、Sr等环境指标指示的长尺度地球环境变迁； 5. 基于网络科学等手段的古生物地理与古生态研究； 6. 基于海量跨学科数据和智能算法的新一代区域和全球古地理重建； 7. 地质记录的周期性与控制机制； 8. 地学大数据的可视化与分析； 9. 基于人工智能技术的数据结构化、自动获取、挖掘、地质要素自动识别等； 10. 地学图像识别与虚拟现实； 11. 奥陶-志留系黑色页岩综合研究，全球界线层型研究。 开授课程科研项目团队近期科研与人才项目： - 基金委“特提斯地球动力系统”重大研究计划，集成项目“定量重建特提斯演化过程中的生物演变及其环境背景”，课题负责人，2023-2026 - 基金委重大项目，第一课题“石炭纪—三叠纪高分辨率全球生物多样性演变”，王向东教授牵头，团队多名成员参与，2023-2027 - 科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目的青年科学家项目，人工智能学院钱超副教授牵头，团队多名成员参与，2023-2026 - 基金委原创探索计划项目“建立全球统一的高精度地质时间轴”，沈树忠院士牵头，团队多名成员参与，2023 - 内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室2023年度自主课题“深时地球大数据与生命演化”，课题负责人，2023- - 国家留学基金委创新型人才国际合作培养项目“地学大数据与地球演化”，项目负责人，2022-2024 - 国家重点研发计划“全球古地理重建与深时大数据关键技术研究”，课题“深时地层古生物数据自动获取和数字化技术”，课题负责人，2019.08-2023.07 - 国家杰出青年基金项目，“定量地层学、定量古生物学与定量古地理学”，课题负责人，2018.01-2022.12 学术成果已发表160余篇期刊论文与专著，包括Science、PNAS、Earth-Science Reviews等；开发软件二十余项。2017年以来发表学术论著64篇。 1. 深时生命演化 - Deng, Y. Y., Fan, J. X.*, Yang, S. C., Shi, Y. K., Lu, Z. B., Xu, H. Q., Sun, Z. Y., Zhao, F. Q., Hou, Z. S., 2023. No Furongian Biodiversity Gap: Evidence from South China. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 618: 111492 https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2023.111492 - Deng, Y.Y., Fan, J.X.*, Zhang, S.H., Fang, X., Chen, Z.Y., Shi, Y.K.*, Wang, H.W., Wang, X.B., Yang, J., Hou, X.D., Wang, Y., Zhang, Y.D., Chen, Q., Yang, A.H., Fan, R., Dong, S.C., Xu, H.Q., Shen, S.Z., 2021. Timing and patterns of the Great Ordovician Biodiversification Event and Late Ordovician mass extinction: Perspectives from South China. Earth-Science Reviews, 220: 103743. https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2021.103743 - Shi, Y. K.*, Wang, X. D., Fan, J. X., Huang, H., Xu, H. Q., Zhao, Y. Y., Shen, S. Z. 2021. Carboniferous-earliest Permian marine evolutionary biodiversification event (CPBE) during the Late Paleozoic Ice Age. Earth-Science Reviews, 220: 103699. https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2021.103699 - Zhang, S. H.*, Fan, J.X., Morgan, C.A., Henderson, C.M., Shen, S.Z.*, 2021. Quantifying the middle–late Cambrian trilobite diversity pattern in South China. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 570: 110361. https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2021.110361 - Fan, J.X., Shen, S.Z.*, Erwin, D.H., Sadler, P.M., MacLeod, N., Cheng, Q.M., Hou, X.D., Yang, J., Wang, X.D., Wang, Y., Zhang, H., Chen, X., Li, G.X., Zhang, Y.C., Shi, Y.K., Yuan, D.X., Chen, Q., Zhang, L.N., Li, C., Zhao, Y.Y., 2020. A high-resolution summary of Cambrian to Early Triassic marine invertebrate biodiversity. Science, 367: 272–277. https://doi.org/10.1126/science.aax4953 2. 地质历史中重大生物事件的环境控制机制 - Liu, Y., Li, Y. C., Hou, M. C., Shen, J., Algeo, T. J., Fan, J. X., Zhou, X. L., Chen, Q., Sun, Z. Y., Li, C., 2023. Terrestrial rather than volcanic mercury inputs to the Yangtze Platform (South China) during the Ordovician-Silurian transition. Global and Planetary Change, 104023. https://doi.org/10.1016/j.gloplacha.2022.104023 - Fang, Q., Wu, H. C., Shen, S. Z., Fan, J. X., Hinnov, L. A., Yuan, D. X., Zhang, S. H., Yang, T. S., Chen, J., Wu, Q. 2022. Astronomically paced climate evolution during the Late Paleozoic icehouse-to-greenhouse transition. Global and Planetary Change, 213: 103822. https://doi.org/10.1016/j.gloplacha.2022.103822 - Lv, Y.W., Liu, S.A.*, Wu, H.C., Sun, Z.Y., Li, C., Fan, J.X., 2022. Enhanced organic carbon burial intensified the end-Ordovician glaciation. Geochemical Perspectives Letters, 21: 13-17. - Chen, J.T.*, Montañez, I.P.*, Zhang, S., Isson, T.T. Macarewich, S.I., Planavsky, N.J., Zhang, F.F., Rauzi, S., Daviau, K., Yao, L., Qi, Y.P., Wang, Y., Fan, J.X., Poulsen, C.J., Anbar, A.D., Shen, S.Z., Wang, X.D.*, 2022. Marine anoxia linked to abrupt global warming during Earth's penultimate icehouse. PNAS, 119(19): e2115231119. https://doi.org/10.1073/pnas.2115231119 - Yang, S. C., Hu, W. X.*, Fan, J. X., Deng, Y. Y., 2022. New geochemical identification fingerprints of volcanism during the Ordovician-Silurian transition and its implications for biological and environmental evolution. Earth-Science Reviews, 228: 104016. - Jiang, L., Cai, C.F., Xiang, L., Fan, J.X., Li, K.K., Cai, L.L., Algeo, T.J., Zhang, F.F., 2022. Kerogen-specific isotope variations during the end-Permian mass extinction in South China. Earth-Science Reviews, 226: 103912. https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2021.103912 - Yang, S. C., Hu, W. X., Wang, X. L., Fan, J. X., 2021. Nitrogen isotope evidence for a redox-stratified ocean and eustasy-driven environmental evolution during the Ordovician–Silurian transition. Global and Planetary Change, 207: 103682. https://doi.org/10.1016/j.gloplacha.2021.103682. - Li, C., Zhang, J. P., Li, W. J., Botting, J., Chen, Q., Fan, J. X., Zhang, Y. D., 2021. Multiple glacio-eustatic cycles and associated environmental changes through the Hirnantian (Late Ordovician) in South China. Global and Planetary Change, 207: 103668. - Li, N., Li, C., Algeo, T. J., Cheng, M., Jin, C.S., Zhu, G.Y., Fan, J.X., Sun, Z.Y., 2021. Redox changes in the outer Yangtze Sea (South China) through the Hirnantian Glaciation and their implications for the end-Ordovician biocrisis. Earth-Science Reviews, 212: 103443. https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2020.103443 - Liu, Y., Li, C., Fan, J.X., Peng, P.A., Algeo, T.J., 2020. Elevated marine productivity triggered nitrogen limitation on the Yangtze Platform (South China) during the Ordovician-Silurian transition. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 554: 109833. https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2020.109833 - Na Li, Chao Li*, Junxuan Fan, Thomas J. Algeo, Detian Yan, Guangyou Zhu, Shiyong Wu, Shida Tang, Meng Cheng, Chengsheng Jin, 2019. Sulfate-controlled marine euxinia in the semi-restricted inner Yangtze Sea (South China) during the Ordovician-Silurian transition. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 534: 109281. - Zhanhong Liu, Thomas J. Algeo*, Xusheng Guo, Junxuan Fan*, Xuebin Du, Yongchao Lu, 2017. Paleo-environmental cyclicity in the Early Silurian Yangtze Sea (South China): Tectonic or glacio-eustatic control? Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 466: 59-76.https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2016.11.007 3. 地学大数据、全球平台、知识图谱、数据挖掘 - Zhang, L. N.*, Hou, Z. S., Shen, B. H., Chen, Q., Dong, S. C., Fan, J.X.*, accepted. Paleobiogeographic knowledge graph: an ongoing work with fundamental support for future research. Journal of Earth Science. - Xu, H. Q., Zhao Y. Y., Huang, H.*, Dong, S. C., Shi, Y. K., Fan, J.X.*, 2022. A comprehensive construction of the domain ontology for stratigraphy. Geoscience Frontiers, 101461. https://doi.org/10.1016/j.gsf.2022.101461 - Wang, C. S.*, Hazen, R. M., Cheng, Q. M., Stephenson, M. H., Zhou, C.H., Fox, P., Shen, S. Z., Oberhänsli, R., Hou, Z. Q., Ma, X. G., Feng, Z. Q., Fan, J. X., Ma, C., Hu, X. M., Luo, B., Wang, J. L., Schiffries, C. M., 2021. The Deep-time Digital Earth program: data-driven discovery in geosciences. 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Lower Aeronian (Llandovery, Silurian) graptolites of the genera Rastrites and Stavrites: systematics, biostratigraphy and palaeobiogeography. Papers in Palaeontology, e1429. DOI: 10.1002/spp2.1429 - Chen, Z.Y., Männik, P., Fan, J.X., Wang, C.Y., Chen, Q., Sun, Z.Y., Chen, D.Y., Li, C., 2021. Age of the Silurian Lower Red Beds in South China: Stratigraphical evidence from the Sanbaiti section. Journal of Earth Science, 32(3): 524-533. https://doi.org/10.1007/s12583-020-1350-6 - Wang, X.D.*, Hu, K.Y.*, Shi, Y.K.*, Chen, J.T., Yang, S.R., Ye, X.Y., Li, X.M., Song, Y.F, Chen, B., Sheng, Q.Y., Chang, X.L., Zhang, Y.C., Fan, J.X., Shen, S.Z., 2021. The missing upper Carboniferous in the Cimmerian Continent: A critical review. 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