科研获奖
Ø2010年1月教育部高等学校科学技术奖科技进步一等奖“区域地面沉降模拟及其应用”（6/7，排名第六，薛禹群，吴吉春，张云，吴剑锋，叶淑君，施小清，谢春红）
Ø2014年12月教育部高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）科技进步一等奖“复杂条件下地下水数值模型及其应用” （3/6，排名第三，吴吉春，吴剑锋，施小清，蒋建国，祝晓彬，叶淑君）
Ø2016年2月江苏省科技进步三等奖“江苏省地下水现代化管理的关键技术及其应用”（4/7，排名第四，吴吉春, 冯志祥, 姚炳魁, 施小清，季红飞, 黄晓燕, 张秝湲；南京大学, 江苏省节约用水办公室, 江苏省地质调查研究院）
Ø2020年6月2019年度刘光文青年科技奖（中国水利学会、水利部水文局和河海大学）
Ø2020年，废弃矿井地下水污染风险评价与控制技术2020-2114-R07，中国煤炭工业协会科学技术二等奖，排名7/9，冯启言、周来、朱雪强、李向东、曾献奎、吴江峰、施小清、吴吉春、陈忠胜
Ø2022年，土壤-地下水系统中典型新污染物运移过程及环境效应（9/9，排名第九），教育部自然科学二等奖，孙媛媛，吴吉春，杜文超，徐红霞，许美玲，吕雪艳，孙凯璇，郭红岩，施小清
指导学生获奖
[1]2014年南京大学本科优秀毕业论文（设计）一等奖（莫绍星）
[2]2014年12月，第二届“共享杯”大学生科技资源共享与服务创新实践竞赛三等奖，王文琪, 尤楠, 尹鑫
[3]2017年南京大学本科优秀毕业论文特等奖（兰天）
[4]2017年江苏省普通高校本科优秀毕业设计（论文）一等奖（兰天）
[5]2017年李四光优秀大学生提名奖（兰天）
[6]2018年第一届中国大学生水环境模型大赛二等奖（宗成元）
[7]2019年南京大学本科生实践教学优秀指导教师