2017年，被评为中国科学院院士
2014年，杨经绥获中国地质科学院新华联杰出贡献奖
2011年，《青藏高原地体拼合和碰撞造山》项目获国家自然科学二等奖（排名第一）
2011年，被评为美国地质学会会士
2011年，被评为美国矿物学会会士
2010年，《青藏高原地体拼合、碰撞造山及隆升机制》项目获国土资源部科技进步一等奖（排名第一）
2009年，获第十一届李四光地质科学奖
2008年，《大陆深俯冲和科学钻探》项目获国土资源部科技进步一等奖(排名第二)
2008年，获国务院颁发的科学技术事业突出贡献政府特殊津贴
2007年，获何梁何利科技进步奖
2006年，国土资源部“十五”重点科技项目《中国巨型超高压变质带及南北板块汇聚》获国土资源部“国土资源科技技术奖”二等奖(排名第一)
2005年，获国土资源部颁发的“中国大陆科学钻探工程先进工作者”荣誉称号
2003年，获中央组织部、人事部、宣传部、教育部、统战部、科学技术部六部委颁发的《留学回国人员成就奖》
1992年，《昆仑开合构造》项目获地质矿产部科技进步三等奖(排名第二)